Как можно сделать обе работы вместе vhost_alias работает отлично без proxypassmatch и fpm отлично работает в эксклюзивном vhost, его можно использовать% from vhost_alias?
<IfModule mod_vhost_alias.c>
<VirtualHost *:80>
ServerAlias *.*.in
UseCanonicalName Off
VirtualDocumentRoot /var/www/html/%2/%1/public
ProxyPassMatch ^/(.*\.php(/.*)?)$ fcgi://127.0.0.1:9000/var/www/html/%2/%1/public/$1
</VirtualHost>
</IfModule>
Вы не можете получить доступ к этим переменным в любых директивах, отличных от mod_vhost_aliases.